Raras

Reliability

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How to connect

Add it to any MCP client that supports remote servers.

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  "mcpServers": {
    "raras": {
      "type": "http",
      "url": "https://raras.org/api/mcp"
    }
  }
}

20 tools

• search_diseases

  Full-text search em 10.468 doenças raras. Suporta filtros SUS/trials.

• get_disease_detail

  Fenótipos HPO, genes, SUS, trials, descrição clínica em PT.

• find_diseases_by_phenotypes

  Match por IDs HPO. Use para diagnóstico diferencial.

• search_phenotypes

  Lookup HPO em PT-BR (encoder Araras-HPO-Brasil + léxico leigo) ou EN (vocabulário HPO). Retorna IDs HP: com estado de asserção: termo NEGADO ("nunca desmaiei") NÃO vira fenótipo. Outros idiomas não são cobertos. Limite de taxa: use poucas chamadas por minuto (429 = espere).

• get_sus_coverage

  CEAF, SIGTAP, PNTN, nível de integração.

• find_reference_centers

  Centros por doença e/ou UF, com CNES.

• find_active_trials

  Trials ativos com filtro Brazil.

• find_similar_diseases

  Vector similarity via embeddings SOTA.

• find_phenotypically_similar

  Doenças com perfil de fenótipos HPO semelhante (simGIC pré-computado, explicável: nº de fenótipos em comum). Complementa find_similar_diseases (semântico).

• get_graph_stats

  Contagens e métricas do dataset.

• search_papers_semantic

  Busca vetorial sobre 424k papers do PubMed. Use caso clínico, pergunta ou conjunto de sintomas.

• find_papers_for_disease

  Literatura relacionada a uma doença via embeddings (:SEMANTIC_MATCH, fallback vetorial).

• analyze_clinical_case

  Caso clínico → doenças candidatas + literatura relevante em 1 chamada. Apenas informativo, nunca diagnóstico.

• get_schema

  Node labels, relationship types e property keys do grafo. Use antes de cypher_query.

• explain_relation

  Raciocínio fundamentado sobre o grafo: dada uma pergunta (ex.: "por que o gene X se associa à doença Y?", "como a droga Z se relaciona a esta doença?"), retorna caminhos de evidência multi-hop (doença↔gene↔via↔droga↔fenótipo) com proveniência citável. Se não houver caminho no…

• get_literature_relations

  Relações tipadas extraídas da literatura biomédica (associate/treat/cause/inhibit/stimulate/prevent) entre a doença e genes/fármacos, com nº de publicações como proveniência. Filtrável por predicado.

• get_hypotheses

  Candidatos a reposicionamento de fármacos gerados por associação de genes (guilt-by-association): drogas que tratam outras doenças que compartilham genes com esta. HIPÓTESES para investigação, NUNCA recomendações clínicas — cada uma rastreável (via gene X, da doença Y).

• get_research_log

  Registro cronológico do que o agente autônomo fez por esta doença: autoria, mineração de literatura, evidência genética, verificação, prospecção de fontes, recomputação de relações. Prova de que o gêmeo digital estuda a doença continuamente.

• get_recent_updates

  Doenças cujo gêmeo digital ganhou evidência nova (autoria, PubTator3, Open Targets, verificação) nos últimos N dias. Faça polling para acompanhar mudanças (substituto stateless de subscriptions).

• get_evidence

  Cross-references de autoridade (Orphanet, MONDO, OMIM, MeSH, GARD, UMLS), status de verificação e PMIDs de uma doença. A base da regra "nunca inventar".

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